Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Six6os1Q9CTN5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six6os1Q9CTN5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms