Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Klhl28Q9CR40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms