Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm4sf20Q9CQY8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf20Q9CQY8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm4sf20Q9CQY8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms