Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg12Q9CQY1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg12Q9CQY1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms