Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1lc3bQ9CQV6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1lc3bQ9CQV6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms