Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl39lQ9CQD0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl39lQ9CQD0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms