Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc5Q9CQA1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc5Q9CQA1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.5 ms