Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp3Q9CQ10 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1680.9 ms