Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc198Q9CPZ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc198Q9CPZ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms