Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg3Q9CPX6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atg3Q9CPX6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atg3Q9CPX6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms