Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rwdd4Q9CPR1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd4Q9CPR1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd4Q9CPR1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms