Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80bQ99PT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ino80bQ99PT3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ino80bQ99PT3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms