Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt23Q99PS0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt23Q99PS0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms