Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim12aQ99PQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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