Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2a1Q99PM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2a1Q99PM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms