Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep41Q99NF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 369.9 ms