Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Rims1Q99NE5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rims1Q99NE5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rims1Q99NE5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms