Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KarsQ99MN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KarsQ99MN1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KarsQ99MN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KarsQ99MN1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms