Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms