Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2aQ99KJ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms