Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa5aQ99KC8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5aQ99KC8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5aQ99KC8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms