Protein–RNA interactions for Protein: Q99K95

Rtfdc1, Protein RTF2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtfdc1Q99K95 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtfdc1Q99K95 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtfdc1Q99K95 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtfdc1Q99K95 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtfdc1Q99K95 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtfdc1Q99K95 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms