Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nlgn1Q99K10 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nlgn1Q99K10 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nlgn1Q99K10 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms