Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrabdQ99JY4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrabdQ99JY4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms