Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfxn1Q99JR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfxn1Q99JR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms