Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Def8Q99J78 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Def8Q99J78 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Def8Q99J78 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms