Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1dQ99246 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1dQ99246 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1dQ99246 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms