Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc6Q924W5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc6Q924W5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc6Q924W5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc6Q924W5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc6Q924W5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc6Q924W5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc6Q924W5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms