Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt16hQ920B9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt16hQ920B9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms