Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Afg3l1Q920A7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg3l1Q920A7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms