Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SncbQ91ZZ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SncbQ91ZZ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms