Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PccaQ91ZA3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PccaQ91ZA3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PccaQ91ZA3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms