Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx4Q91YJ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx4Q91YJ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx4Q91YJ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx4Q91YJ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx4Q91YJ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx4Q91YJ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx4Q91YJ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms