Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp3Q91W36 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp3Q91W36 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms