Protein–RNA interactions for Protein: Q91VY5

Kdm4b, Lysine-specific demethylase 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4bQ91VY5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm4bQ91VY5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4bQ91VY5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4bQ91VY5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4bQ91VY5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms