Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snx9Q91VH2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms