Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abcc2Q8VI47 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abcc2Q8VI47 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc2Q8VI47 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc2Q8VI47 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Abcc2Q8VI47 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Abcc2Q8VI47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc2Q8VI47 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc2Q8VI47 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc2Q8VI47 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc2Q8VI47 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms