Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmcd1Q8VEE1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmcd1Q8VEE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms