Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn4Q8VCH8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn4Q8VCH8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms