Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300ldQ8VCH2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300ldQ8VCH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms