Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc9Q8VC31 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms