Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c5Q8R2T8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf3c5Q8R2T8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms