Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r200Q8R281 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms