Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf183Q8QZS5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf183Q8QZS5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms