Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prpf39Q8K2Z2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms