Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sde2Q8K1J5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sde2Q8K1J5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms