Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago3Q8CJF9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago3Q8CJF9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ago3Q8CJF9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ago3Q8CJF9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ago3Q8CJF9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ago3Q8CJF9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ago3Q8CJF9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ago3Q8CJF9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ago3Q8CJF9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ago3Q8CJF9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms