Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klre1Q8CJC7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klre1Q8CJC7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klre1Q8CJC7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms