Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Celf3Q8CIN6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Celf3Q8CIN6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Celf3Q8CIN6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Celf3Q8CIN6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms