Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopaQ8CIE6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms